SoftGenetics Mutation Surveyor 5.1.2

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SoftGenetics Mutation Surveyor 5.1.2

SoftGenetics Mutation Surveyor software includes patented anti-correlation technology, which physically compares sample sequence traces to a reference trace, providing accuracy up to 99.5% with Phred 20 bi-directional sequences and a sensitivity of 5% of the primary peak

Mutation Surveyor software is a powerful and accurate DNA Sequencing analysis tool for Sanger Sequencing files generated by the following electrophoresis systems:

• Applied Biosystems Genetic Analyzers
• Beckman CEQ
• Promega Spectrum Compact CE System

Capable of performing variant analysis of up to 2000 Sanger sequencing files (.ab1, .RSD, .ESD & .scf) in 15 minutes, Mutation Surveyor delivers excellent accuracy, sensitivity, and low false-positive and false-negative rates in the analysis of DNA variants, including:

• Single nucleotide polymorphisms (SNPs)
• Homozygous insertions and deletions (indels)
• Deconvolution and detection of heterozygous indels
• Somatic mutations in direct sequencing.

The Mutation Surveyor package includes patented anti-correlation technology (U.S. Patent 8,086,410), which physically compares sample sequence traces to a reference trace, providing accuracy up to 99.5% with Phred 20 bi-directional sequences and a sensitivity of 5% of the primary peak.

Mutation Surveyor software features many tools:

• Custom reporting
• Automated download of annotated GenBank reference files
• DNA methylation detection
• Mitochondrial DNA sequence analysis
• Allele quantification
• Variant Knowledge Database

Mutation Surveyor software includes features designed to enhance and optimize the process of variant discovery in Sanger sequencing traces. One such feature is the variant knowledge database which allows users to track variants by chromosomal position, indicate false-positives and other artifacts, and query mutation annotation information from popular variant databases such as dbSNP, dbNSFP, ClinVar, gnomAD, and COSMIC.

Also included in Mutation Surveyor software is an intuitive user management system, which enables administrators to set up password-protected user names, control access rights, and generate a user audit trail. Access rights for each user are determined by the administrator, providing assurance that unauthorized individuals do not accidentally alter a project or change the analysis parameters established by the laboratory. User management also provides the user ID in the header of the final reports.

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La versión descifrada de MutationSurveyor es una herramienta de análisis de secuenciación de ADN potente y precisa para archivos de secuenciación Sanger generados por los analizadores genéticos de Applied Biosystems, los sistemas de electroforesis MegaBACE y Beckman CEQ. Capaz de realizar análisis de mutaciones en hasta 2000 archivos de secuenciación Sanger (.ab1, .RSD, .ESD y .scf) en 15 minutos, Mutation Surveyor ofrece una precisión y sensibilidad excepcionales y bajas tasas de falsos positivos en el análisis de ADN y variantes de tasas de falsos negativos. incluyendo: polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), inserciones y deleciones (INDELS) y mutaciones somáticas en proyectos de secuenciación directa, secuenciación por PCR, secuenciación de ADN mitocondrial y resecuenciación.

 

El paquete incluye tecnología anticorrelación patentada que compara físicamente los rastros de secuencia de muestra con los rastros de referencia, brindando hasta un 99,5 % de precisión utilizando secuencias bidireccionales Phred 20 con una sensibilidad del 5 % del pico primario. Con mayor precisión y sensibilidad, Mutation Surveyor proporciona a investigadores y médicos muchas herramientas, incluida la descarga automática de archivos de referencia anotados de GenBank, detección y desconvolución de indeles heterocigotos, detección de metilación del ADN, análisis de secuencias de ADN mitocondrial, cuantificación de alelos y una variedad de informes personalizados. opciones.

• La versión 5.0 del software Mutation Surveyor incluye nuevas funciones diseñadas para mejorar y optimizar el proceso de descubrimiento de variantes en los rastros de secuenciación de Sanger. En la versión 5.0 se incluye una nueva base de datos de conocimiento de variantes, que permite a los usuarios rastrear variantes por ubicación cromosómica, indicar falsos positivos y otros artefactos, y consultar información de bases de datos de variantes de bases de datos de variantes populares como dbSNP, dbNSFP y COSMIC.
• La versión 5.0 del software Mutation Surveyor también incluye un sistema de gestión de usuarios que permite a los administradores establecer nombres de usuario protegidos con contraseña, controlar los derechos de acceso y generar pistas de auditoría de usuarios para cada proyecto de análisis. Los derechos de acceso de cada usuario los determina el administrador, lo que garantiza que personas no autorizadas no puedan alterar accidentalmente los proyectos ni alterar los parámetros analíticos establecidos en el laboratorio. La Gestión de usuarios también proporciona la identificación del usuario y la organización en el título del informe final. Cada cambio en un proyecto es capturado y registrado por el usuario.

Instalación y activación de SoftGenetics Mutation Surveyor 5.1.2