SoftGenetics NextGENe 2.4.3

NextGENe® Next Generation Sequencing Software

NextGENe software is the perfect analytical partner for the analysis of desktop sequencing data produced by Illumina® iSeq, Miniseq, MiSeq, NextSeq, HiSeq, and NovaSeq systems, Ion Torrent Ion GeneStudio S5, PGM, and Proton systems as well as other platforms.

NextGENe software runs on a Windows® Operating System, which provides a biologist-friendly ‘point & click’ interface. It does not require scripting or other bioinformatics support, which are often required when using programs such as CLC Genomics Workbench, Lasergene’s SeqMan Pro, as well as academic software such as MAQ & SOAP, Top Hat, BWA & Bowtie.

NextGENe software employs unique platform-specific technologies in one free-standing multi-application package. NextGENe software contains analysis modules for:

• SNP/Indel detection
  • Germline
  • Somatic
  • Exome Capture, Whole Exome Sequencing (WES)
  • Whole Genome Sequencing (WGS)
• Structural Variant Analysis (including fusion gene detection)
• Family-based and Trio comparisons
• Tumor-normal comparisons
• Copy Number Variation (CNV) detection and alternative to MLPA-like screening
• de novo assembly
• Transcriptome; Alternative Splicing Analysis & Transcript Expression levels
• ChIP-Seq, Digital Gene Expression (DGE), miRNA Analysis & Quantification & Metagenomicss

NextGENe software is designed in a biologist friendly Windows® environment significantly reducing the need for additional bioinformatics resources and costs. NextGENe software utilizes low cost 64-bit Windows OS based hardware.

SoftGenetics NextGENe 2.4.3

NextGENe est le  nom d’un logiciel d’ingénierie et spécialisé dans le domaine du séquençage en biologie. En fait, ce logiciel peut être mentionné comme un outil d’analyse pour analyser les données de séquence. Ce produit vous fournira également des solutions complètes pour effectuer une analyse de séquence mieux que tout autre logiciel. Le logiciel devant vous utilise également des modules d’analyse très puissants et variés pour l’analyse structurelle, la CNV, les combinaisons d’exons alternés, les polymorphismes mononucléotidiques, etc.

Le logiciel NextGENe utilise une technologie spéciale et unique dans un package multi-application autonome. Une multitude d’outils très efficaces tels que les outils de sensibilité à l’aneuploïdie (SAD), les outils d’analyse HLA, les outils de prédiction et de détection des maladies rares, les outils d’alignement du génome, etc. ont fait de ce produit un logiciel puissant et spécialisé. Est. Ce produit est préparé et publié pour le système d’exploitation Windows.

L’une des principales caractéristiques de ce produit est que le programme n’a pas besoin de scripts ni d’autres supports bioinformatiques. Ce produit vous permettra d’accéder aux données statistiques dans un environnement pratique et précis. Un autre point important à cet égard est la compatibilité totale de GRCh37 avec ce logiciel.

Caractéristiques et spécifications du logiciel NextGENe :

• Bénéficiez de modules d’analyse de séquence puissants, précis et avancés
• Utilisation de l’outil CNV pour analyser la variation du nombre de copies
• Capacité à analyser HLA et à détecter les maladies rares avec des capacités prédictives
• Possibilité de comparer des triplets et plusieurs exemples de variables souhaitées
• Analyse du panneau ThunderBolts et analyse du panneau NEBNext Direct